Biología Molecular de Patógenos Bacterianos

Descripción

Las infecciones bacterianas son un grave problema de salud pública que se ha visto acrecentado por la aparición de patógenos resistentes a la mayoría de los antibióticos utilizados en la práctica clínica.    El diagnóstico, prevención y tratamiento de las enfermedades infecciosas son objetivos fundamentales de todas las políticas de actuación, tanto a nivel nacional como internacional.

Objetivos

Profundizar en el conocimiento de las bases moleculares de las infecciones para avanzar en el diseño, desarrollo e implementación de tratamientos eficaces.

  • Estudio de mecanismos moleculares implicados en la patogénesis, la resistencia antimicrobiana, así como en la diseminación y persistencia de estos agentes infecciosos en el ambiente y en el hospedador, enfocados principalmente en patógenos Gram-negativos (Haemophilus influenzae, Pseudomonas aeruginosa) y Gram-positivos (Staphylococcus aureus).

Tres líneas principales

  • Estudio de los mecanismos moleculares de regulación que controlan la expresión de los genes bacterianos importantes para la virulencia, la resistencia a los antimicrobianos y la persistencia en el medio ambiente. Identificación y caracterización de los mecanismos reguladores mediados por moléculas de RNA y las proteínas de unión a RNA asociadas.
  • Caracterización de las interacciones moleculares en comunidades microbianas. Investigación de los procesos que rigen la organización de las bacterias en comunidades microbianas y sus interacciones moleculares. Entender su función biológica y su implicación en el desarrollo de enfermedades.
  • Caracterización de interacciones patógeno-hospedador en el nicho infectado de forma persistente, y los mecanismos de evasión de la inmunidad innata soluble y celular que favorecen la cronicidad. Investigamos los rasgos genómicos de pato-adaptación evolutiva que muestran los patógenos en el nicho colonizado, y el significado biológico de los mismos en la subversión de la inmunidad del hospedador, para la identificación, desarrollo y explotación de nuevas dianas terapéuticas y antimicrobianos.

Investigadores principales

AToledoArana
Alejandro Toledo-Arana
Investigador Científico

a.toledo.arana@csic.es

(+34) 948 169 752

Jaione Valle Turrillas
Científico Titular

jaione.valle@csic.es

(+34) 948 169 752

Juncal Garmendia García
Investigadora Científica

juncal.garmendia@csic.es

(+34) 948 168 484

Proyectos I+D

 

PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN POR EL DEPARTAMENTO DE SALUD 2023

PROYECTO MICRO-PRON-EPOC – “Identificación de marcadores microbiológicos pronósticos en pacientes EPOC mediante análisis de microbiota en el eje boca-pulmón asistido por herramientas de aprendizaje automático”.

El objetivo de la convocatoria es promover la realización de proyectos de investigación, de carácter plurianual, en disciplinas biomédicas, ciencias de la salud y sociosanitarias en las áreas de mayor impacto sobre la salud y de mayor repercusión en el Sistema Sanitario de Navarra, fomentando la colaboración entre profesionales de diferentes áreas de conocimiento.

– Proyecto financiado por el Gobierno de Navarra.
– Investigadora principal: Juncal Garmendia García.
– Duración: 2024-2026.
– Presupuesto: 79.932,71 €.

AYUDAS PARA CONTRATOS PREDOCTORALES PARA LA FORMACIÓN DE DOCTORES 2022

Cofinanciación por parte de la Agencia Estatal de Investigación y del Fondo Social Europeo Plus (FSE+)

– Investigadora Principal/Directora de Tesis: Juncal Garmendia García.
– Duración: 2023-2027.
– Beneficiario: Asier Domínguez San Pedro.

Las ayudas tienen como objeto la formación de doctores/as mediante la financiación de contratos laborales, bajo la modalidad de contrato predoctoral, a fin de que el personal investigador predoctoral en formación realice una tesis doctoral asociada a un proyecto de investigación financiado por las ayudas para proyectos de I+D del Subprograma Estatal de Generación de Conocimiento.

 

Proyectos I+D 2022 “Generación del Conocimiento”

ProFunDSa: “Estudio de las mini-proteínas pertenecientes al proteoma oculto de Staphylococcus aureus para descifrar sus funciones biológicas”.

– Investigador Principal: Alejandro Toledo-Arana
– Duración: 2023-2026.
– Presupuesto: 212.500 €.

– Estas Ayudas han sido financiadas por el Ministerio de Ciencia e Innovación, la Agencia Estatal de Investigación y por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER).

 

PROYECTOS ESTRATEGICOS I+D 2023-2026

PROYECTO VALSANA – “Valorización subproductos agroalimentarios de Navarra”.

Este proyecto se considera Desarrollo Experimental porque pretende emplear conocimientos de biotecnología y química verde para alcanzar una serie de actuaciones novedosas relacionadas con la bioeconomía y la economía circular en los diferentes sectores en los que las empresas del consorcio están presentes (alimentación, salud, energía).

Proyecto cofinanciado por el Gobierno de Navarra y por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) a través del programa FEDER 2021-2027 de Navarra.

– Investigadora principal: Juncal Garmendia García.

– Duración: 2023-2026.

– Presupuesto: 102.642,20 €.

 

Ayudas para la contratación de doctorandos y doctorandas, «Doctorados industriales 2023»

– Organismo financiador: Gobierno de Navarra.
– Directores de Tesis: Alejandro Toledo-Arana y Jaione Valle Turrillas
– Duración: 2023-2026.
– Ayuda concedida: 85.946,72 €.
– Beneficiaria: Ainara Aginaga Etxamendi
– El Gobierno de Navarra ha financiado la contratación de la doctoranda en el marco de la convocatoria de ayudas «Doctorados Industriales 2023»

PROYECTOS EN COLABORACIÓN PÚBLICO-PRIVADA 2021

BIOINSECTIS – “Crafting the next-gen Bt toxins, with no environmental impact, for the specific biocontrol of world-wide relevant insect pests”.

– Investigador Principal: Alejandro Toledo-Arana.
– Duración: 2022-2024.
– Presupuesto: 257.675,24 €. 

PROYECTOS I+D 2021 “GENERACIÓN DEL CONOCIMIENTO”

AMYLGUT: “Amiloides bacterianos como puntos de inflexión en la salud y enfermedad”.

– Investigadora Principal: Jaione Valle
– Duración: 2022-2025.
– Presupuesto: 232.900 €.

Estas Ayudas han sido financiadas por el Ministerio de Ciencia e Innovación, la Agencia Estatal de Investigación y por el FEDER

PROYECTOS I+D 2021 “GENERACIÓN DEL CONOCIMIENTO”

COUNTER-CHRON: “Descifrando la interacción huésped-patógeno en el sistema respiratorio humano para contrarrestar cronicidad y fallo terapéutico”.

– Investigadora Principal: Juncal Garmendia
– Duración: 2022-2025.
– Presupuesto: 280.723 €.

Estas Ayudas han sido financiadas por el Ministerio de Ciencia e Innovación, la Agencia Estatal de Investigación y por el FEDER

PROYECTO I+D 2022 – BIOINSINT – “Potenciación de la actividad de un bioinsecticida Bt contra Spodoptera spp. mediante reformulaciones basadas en biología sintética”.

– Proyecto financiado por el Gobierno de Navarra y por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER).
– Investigador Principal: Alejandro Toledo Arana.
– Duración: 2022-2024.
– Presupuesto: 75.517 €. 

PROYECTO COLABORATIVO POLIFARMA 3D – “Hacia la personalización del tratamiento de infecciones respiratorias crónicas polimicrobianas: evaluación de fármacos sostenibles mediante modelos pulmonares 3D”.

– Proyecto financiado por el Gobierno de Navarra y por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER).
– Investigadora principal: Juncal Garmendia.
– Duración: 2022-2024.
– Presupuesto: 1118.445,10,70€.

Proyectos I+D+i  2019 -Modalidades «Retos Investigación» y «Generación de Conocimiento»

Proyecto PID2019-105216GB-I00 financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033

– Investigador Principal: Alejandro Toledo.
– Duración: 2020-2023.
– Presupuesto: 140.000 €.

Proyectos colaborativos 2020 – NANOFARMACHIP – Desarrollo nanotecnológico de antimicrobianos innovadores y su evaluación farmacológica mediante dispositivos microfluídicos «airway-on-a-chip».

– Organismo financiador: Gobierno de Navarra.
– Investigador Principal: Juncal Garmendia.
– Duración: 2020-2022.
– Presupuesto: 135.627,4 €.

Proyectos colaborativos 2020 – MICROPROGEN – Microbiota y metapeptidómica comparativa en la etiología del Síndrome de Intestino Irritable.

– Organismo financiador: Gobierno de Navarra.
– Investigador Principal: Jaione Valle.
– Duración: 2020-2022.
– Presupuesto: 115.301,9 €.